硫酸软骨素跟氨糖软骨素，这两者最大的区别就是硫酸软骨素是单方药物，而氨糖软骨素是氨基葡萄糖和硫酸软骨素复合而成的复方药物。
一般来说，硫酸软骨素源于深海鲨鱼的软骨，也有资料显示它来源于动物的软骨，是软骨蛋白聚糖的组成部分之一，具有催生关节滑液、润滑关节软骨的作用。同时可以促进骨细胞，促进骨、钙的沉积，促进软骨的再生的作用，还有一定缓解关节疼痛的作用，同时还有抗炎、降血脂的作用。
因为分子量比较大，口服后经人体吸收，效果就会比较差，于是就会有氨基葡萄糖这一类药物，氨基葡萄糖是由天然的虾、蟹壳里面提取而成的，可以激活软骨细胞，合成多糖跟胶原纤维，生成软骨的机制，修复关节的软骨，催生关节的滑液。
氨基葡萄糖最大的好处就是分子量小，而且多数是离子键结合，所以比较容易通过肠道的入血来吸收，从而进入关节软骨，进行蛋白聚糖的组成。有相关的研究证明，如果硫酸氨基葡萄糖和硫酸软骨素联用，效果会更加好一点。
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