septin9基因是结直肠癌筛查的基因。如果查血液中发现基因的检测是阳性，这类患者很有可能是结直肠癌，但并不能确诊结肠癌。通过检查是做初筛，对于检查阳性的患者，还是需要做进一步的肠镜 CT检查评估。
对于结直肠癌的早期筛查，现在早期下达方案也有很多，如septin9的血液检查，包括还可以对患者大便进行基因检测，现在市面上也有试剂盒。还可以通过比较传统的大便隐血试验，如果患者大便隐血是阳性，需要进一步做肠镜检查进一步评估，甚至进一步做CT检查进一步评估。因此septin9基因只是早期的筛查，并不能完全确诊。
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