微卫星不稳定是错配修复基因缺失导致的，不稳定的状态与肿瘤生物学行为直接相关，虽然与结肠癌的预后也相关，但是预后还受制于其它因素的综合影响。比如微卫星高度不稳定的结肠癌患者，虽然预后很好，但是对于氟尿嘧啶单药治疗的效果很差，如果想继续治疗，就不得不选择双药或者其它药物治疗，这样就不得不忍受更多的化疗副反应和费用。
对于微卫星稳定的患者，患者虽然预后相对不好，但是肿瘤细胞对氟尿嘧啶的化疗非常敏感，只要口服氟尿嘧啶，就可以获得更好的疗效。
微卫星不稳定的患者有资格接受免疫治疗的，也不是所有的免疫治疗都有效。然而微卫星稳定的患者，没有资格应用免疫治疗，如果用其它化疗药物失败，再通过免疫治疗获益的机会相对较差。
微卫星不稳定是错配修复基因缺失的结果，但是此类结肠癌患者预后相对较好，也有更多的药物治疗的机会。微卫星不稳定可能和遗传性息肉病相关，潜在存在其它恶性肿瘤的可能，要注意筛查。
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