以前对肠道菌群认识很少，总是认为肠道菌群，可能对于人体没有什么作用。但是随着科技的发展，认识的加深，发现肠道菌群在整个人生命当中，起着非常重要的作用，不但参与代谢，包括三大物质的代谢，糖、脂肪、蛋白质的代谢，同时，定值在粘膜的表面，维护消化整个消化道黏膜的完整性。使这些致病菌，不至于损伤粘膜以及外界的有毒、有害的物质以及物理化学的因素，不至于粘膜产生直接的损害的作用。
第三方面也可以使，肠道里面的条件致病菌，也就是机会菌，还有就是致病细菌，对于肠道的损伤，或者是对于整个人体的损伤，作用主要就是参与整个生命过程当中的物质代谢。对于维持肠黏膜的完整，以及对致病菌、条件致病菌的，抑制作用，起到很大的作用。
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