大便恶臭也是消化内科门诊以及住院患者很常见的主诉，主要的原因是大便里面所含有的蛋白质以及硫化物含量过高。
大便的成分相当复杂，其中主要成分包括硫化物，以及纤维素等等。食物中的蛋白质消化，主要是靠肠道里面的一些细菌，对蛋白质进行分解。而蛋白质里面很多是含有硫元素的，硫元素跟氢元素结合起来，就会形成硫化氢，硫化氢是大便味道里面最主要的一种气味分子。
其他的分子还包括吲哚，吲哚也是大便里面一种很重要的气体分子。特别是在肉类物质以及其它高蛋白物质消化不良的情况下，这些高分子化合物被分解得不彻底的情况下，就会形成比较多的硫化氢和吲哚，就会形成大便味道的异常。
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