胃旁路手术和胃转流手术的区别如下：
1、胃转流手术：这是一个大的解剖概念，一般消化道通过口腔—咽喉部—食管，到达胃—小肠—大肠，这是人体生理、病理自然形成的通道。所谓的胃转流手术就是指，在原有的通道基础上建立了另外的分支结构、通道，简单说就是“在原来的公路基础上又修建了一条公路”，形成了一个新的通道，就叫胃转流手术。
2、胃旁路手术：通常在医学上特指代谢综合征或肥胖患友，做减重手术的一种手术方式（Bypass手术），这种手术要切除很多胃组织。
所以，以上两种手术方式存在一定的差异。严格讲，胃旁路手术隶属于胃转流手术，它属于转流手术中的一种类型。
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