乙肝转阴在临床上认为是治愈。但是最近几年，很多乙肝转阴的患者在长期随访中，又会出现复发或抗原复阳的反应。
医学上的解释是，乙肝病毒非常狡猾，具有一定的欺骗性。乙肝病毒是以DNA的形态整合到正常肝细胞里，自体免疫力或免疫细胞会把认为它是自身的一部分，因此不会进行攻击。所以，相当于乙肝病毒变成体内的一部分，从而躲开了免疫的攻击。
但是在治疗的情况下，很多药物的浓度攻击不了细胞核内的DNA。所以，有很多病毒会潜藏在正常细胞的DNA里，现在有很多科学家或实验室的研究人员发现，不只是要查乙肝DNA或高精度的DNA，甚至要去查乙肝RNA，合并DNA的前提是需要进行RNA的整合。
所以，这些研究也是目前乙肝抗病毒以及乙肝临床治疗的一些新热点。
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