系统性红斑狼疮患者并不是传染性的疾病，所以并不能通过打疫苗来预防。但是如果是系统性红斑狼疮患者，在病情的稳定期能不能打预防其他传染性疾病的疫苗，是可以的。
因为系统性红斑狼疮是自身免疫性疾病，机体的免疫系统是处于紊乱状态的，尤其是在疾病的活动期免疫反应亢进。如果这个时候接种疫苗，疫苗作为一种外源性的抗原，会引起免疫反应，导致发热、头痛、关节痛，甚至肾炎、脑炎等，可能与这个疾病本身的一些临床表现重叠，引起病情的加重，甚至诱发狼疮的复发。
常用的疫苗主要分为两大类，第一类是减毒活疫苗，带有抗原性的疫苗，免疫力比较强，效应也比较持久，但有可能在体内恢复毒力引起发病。另一类是灭活的疫苗，也就是死疫苗，它只有免疫原性，没有抗原性的疫苗。关于系统性红斑狼疮以及其他自身免疫病患者，疫苗接种的问题，欧洲抗风湿病联盟国际的风湿病的诊断和治疗，制定指南的机构有如下建议：
1、尽可能在病情的稳定期来接种灭活的疫苗。免疫功能受抑制的患者，要尽量避免接种减毒活疫苗。
2、使用针对B细胞的生物制剂，比如利妥昔单抗的时候，尽可能在使用前接种疫苗。
3、强烈建议狼疮和其他自身免疫病患者，应该去接种灭活的流感疫苗和23价的肺炎球菌多糖疫苗，但是必须是要在病情稳定的情况下。对于脾功能减退或无脾的患者，推荐接种肺炎球菌、流感嗜血杆菌B和脑膜炎球菌C的疫苗。对于女性的系统性红斑狼疮患者，可以考虑接种人乳头瘤病毒，也就是HPV的灭活疫苗。部分患者可以考虑接种带状疱疹病毒疫苗，如果平时抵抗力比较低，容易反复感冒或感染的患者，推荐接种灭活的带状疱疹病毒疫苗。有感染甲乙型肝炎风险的患者推荐接种相应的灭活疫苗。
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