一般直肠肿瘤不会被误认为肛瘘。肛瘘恶变的机会很少，极罕见的肛瘘病人会出现恶变。肛瘘是由直肠的肛窦引起的炎症，然后由内而外已经形成了脓肿、感染、肛瘘，这跟直肠癌有很大的区别，所以一般肛瘘不会误诊为直肠癌。
如果想进一步鉴别直肠肿瘤和肛瘘，需要找有经验的肛肠外科医生去做详细的直肠肛门检查，比如直肠的指检、肛窥的检查，或者是结肠镜的检查等，从根本上能够区分直肠癌以及肛瘘。
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