肠结核与克罗恩
两者的共同点都可以出现腹痛，发热，呕吐，腹泻，脓血便，里急后重等。肠结核主要是结核杆菌侵犯肠道引起的慢性感染，多数有肠外结核，比如说肺结核等。
克隆氏病是原因不明的慢性的炎症性肠病，两者的临床症状，肠镜下表现很相似，有时比较难区别。主要是通过病理活检，克隆氏病病病理活检，一般提示非干酪样坏死性肉芽肿或大量淋巴细胞聚集，肠结核病理活检是干酪样坏死性肉芽肿或者结核菌。
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