睡醒后头疼的原因常见的有非疾病因素，或颈椎病、阻塞性睡眠呼吸暂停综合征等疾病因素。
一、非疾病因素
长时间睡眠不足、睡眠质量比较差，或睡眠时间过长，容易造成脑部血液循环不良，使脑部缺血、缺氧，出现头疼、头昏脑胀等现象。保持作息规律，营造良好的睡眠环境，有助于缓解机体疲劳，改善不适。
二、疾病因素
1、颈椎病：本身有颈椎病，睡觉过程中姿势不当，导致颈部扭曲幅度过大或长期保持一个姿势，可能会使椎体压迫神经根、血管的现象加重，造成头部血液灌注量不足，发生疼痛、视物模糊等现象。通常可以在医生的指导下使用非甾体抗炎药，比如吲哚美辛片、塞来昔布片、美洛昔康片等缓解疼痛。
2、阻塞性睡眠呼吸暂停综合征：主要发病机制是上气道狭窄、堵塞、塌陷等，发生后容易导致气流循环不畅，在睡眠时出现打鼾、呼吸暂停、有憋气感等症状，造成脑部缺氧，出现晨起头痛的现象。通常可先采取经鼻持续气道正压呼吸、戴口腔矫正器等非手术治疗方式，促进气道通畅，改善症状。
除此之外，还可能是视疲劳、低血糖、神经衰弱综合征、偏头痛、三叉神经痛等疾病导致。通常可以到正规医院的内科就诊，积极配合医生进行相关检查，并采取治疗。
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