适当灌肠通常不会对身体有影响，但次数过多，可能会发生耐药、肠道菌群失调、肠黏膜损伤等。
灌肠是一项严谨的操作，而且操作前和医生会提醒患者做好相关事项，骨整个检查过程都是比较安全的，且副作用相对较小，如果只是短时间灌肠通常不会有太大影响，但如果不按照要求操作，可能会有以下几点危害：
1、耐药：灌肠能够辅助排便，但若长期灌肠，可能会因此耐药，停止灌肠后就无法正常排便，容易出现大便干燥、排便不易等情况。
2、肠道菌群失调：频繁灌肠未做好保护措施，消毒不彻底，可能会影响肠道菌群，造成菌群失调，从而引起腹泻、胀气等，腹泻与便秘可能会交替发生。可遵医嘱服用乳酸菌素片、双歧杆菌四联活菌片等药物调理。
3、肠道黏膜损害：频繁灌肠、操作不当、动作过于粗暴，可能会刺激肠黏膜，导致肠黏膜溃烂，易引起便血、腹痛等。可遵医嘱使用硫糖铝咀嚼片、乳果糖口服溶液等保护胃肠黏膜。
此外，也可能会引起肠痉挛、肠穿孔、肠出血等。建议做完灌肠治疗后定期观察，如有上述不适，需及时到医院消化内科就诊，并按照医生要求规范处理。
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