近日，中山大学附属第六医院左涛研究员在Lancet Microbe（IF = 86.208）上发表了一篇题为“The gut mycobiome in health, disease, and clinical applications in association with the gut bacterial microbiome assembly”的综述。
该综述回顾了健康人群从出生到成年过程中肠道真菌群的组成与功能多样性，从影响肠道菌群的因素（包括饮食、药物、年龄、遗传和免疫系统）、肠道真菌菌群在疾病和治疗中的作用，特别是它们与肠道细菌菌群对宿主免疫的协调作用等角度进行分析，对肠道真菌菌群的基本组成和转化研究的最新进展进行综述，明确了致病性、益生性和条件性真菌在疾病发生过程中的作用，强调了肠道真菌-细菌的相互作用在宿主生理学和病理生理学中的生态效应。
肠道真菌群是人类肠道微生物组中一个微小但非常关键的组成部分，参与调节宿主免疫同源性、病理生理过程以及共存于肠道的细菌微生物组的组装。过去十年里，越来越多的研究对健康和多种病理条件下的肠道真菌菌群进行分析，研究结果表明，肠道真菌菌群协同肠道细菌菌群在人类健康和各种疾病中发挥着至关重要的作用。
该综述还讨论了肠道微生态疗法中肠道真菌的作用，并强调将理论转化为临床实践的途径，特别是在临床治疗方面，利用肠道真菌菌群、细菌微生物组和宿主免疫这三方之间的关系，恢复肠道真菌菌群和微生物组以提高临床疗效。
除了细菌和病毒，人体胃肠道也是大量真菌的寄生之处，寄生数量占肠道微生物数的0.1%，这些真菌在维持人体健康和肠道稳态中起到至关重要的作用。肠道真菌群的失调与自身免疫、代谢、神经系统疾病乃至癌症等许多疾病密切相关，如肥胖、糖尿病、炎症性肠病（IBD）、结直肠癌和阿尔兹海默症等。
图1：肠道真菌群和宿主免疫之间的相互作用与细菌菌群的组装有关
（ASCA: 抗酿酒酵母菌抗体；Treg: 调节性T细胞；Th17: 辅助性T17细胞）
肠道中条件性、致病性真菌的定植和生长会诱导宿主的免疫反应出现失调，从而影响疾病的发生进程。肠道真菌，尤其是念珠菌，会影响肠道细菌微生物组（另一种主要的宿主生理调节因子）的组装和功能。这些肠道真菌、细菌和宿主免疫之间相互作用，该机制是人类免疫同源性的基础，对机体健康的维持、疾病的发生及发展都有影响。然而，在基于微生物群的治疗方法开发过程中，肠道真菌在很大程度上仍然被忽视，现有的真菌群研究结果也没有在临床实践中得到充分利用。
图2：宿主肠道真菌和细菌之间的跨界相互作用
这篇综述主要从肠道菌群在健康人群中的作用、各种疾病中肠道菌群的生态失衡及其有害作用、肠道真菌-细菌-宿主免疫三者间错综复杂的关系以及肠道菌群的临床应用（包括粪便微生物群移植（FMT）、饮食干预、抗真菌素、益生菌和抗生素）等个多方面进行讨论和分析，旨在总结该领域的相关基础、转化研究以及相关临床研究的最新进展，以提高研究人员对肠道菌群在健康人群和各种疾病病理发生过程中所扮演的角色的理解，并将肠道真菌群、细菌群和宿主免疫联系在一起，为今后更好的临床实践提供重要信息。
图3：基于肠道菌群改造的临床治疗途径
生长良好的肠道真菌群与细菌群之间的互惠关系对人体健康至关重要，在未来，肠道真菌群极有可能被作为精准医疗方法的一部分用于疾病诊断、预后和治疗干预。在肠道真菌群、细菌菌群以及人类病理生理学基础、转化和临床知识基础上，未来的微生物靶向治疗应该定向协同调节肠道真菌和细菌，这对提高临床疗效将具有一定的促进作用。
（通讯员：简文杨、唐小雨）
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