咽拭子只在舌头上擦了擦能否检测出病菌，视具体情况而定。
1、能：正常人咽峡部寄居有正常菌群而无致病菌，当致病菌侵袭喉部时，咽喉以及扁桃体出现炎性分泌物，由于咽部和舌头离得较近，分泌物可能也会浸润到舌根上，此时用咽拭子棉签在舌头上擦擦，一般可以检测出病菌。
2、不能：若是使用咽拭子棉签不规范，只在舌尖或舌体上擦了擦，沾到的咽部和扁桃体分泌物本身较少，口腔内的唾液淀粉酶或食物残渣等再将分泌物进一步冲淡，可能会造成结果不准或无法检出，即不能检出病菌。
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