芒果的保质期较短，不宜长期存放，一般两至三天内食用效果最佳。芒果的果皮中含有多酚类的抗霉素，因此在运输或者转移的过程中遭到挤压时，表皮便容易产生黑色的斑点，但这种褐变情况与芒果储放时间过长引起的发黑有所不同，因为黑斑并不会导致果肉变色，对人体的健康也不会造成影响，因此在挑选芒果的时候应该注意区分。
芒果心发黑代表内部已变质，变质后会滋生大量细菌。吃了反而会因为细菌而引发腹痛、腹泻现象。
发黑的芒果中产生的黄曲霉素，是一种致癌物质，这种物质会对人体的健康产生损害。芒果心发黑意味着芒果的储放时间过长，使得芒果里边被氧化了，其营养元素也遭到了破坏，属于不新鲜的水果，因此不宜再食用。
芒果应该避免放入冰箱存放。因为其耐寒性较差，放入冰箱容易损坏芒果，使其表皮出现黑斑而加快腐坏的过程。可以把芒果放在纸盒里，在纸盒上挖一个孔，放在避光的角落里，也可使芒果得到较好的保存。也可以将芒果用纸包起来，放在阴凉避光的通风处存放，可使得芒果在不损坏的情况下保存几天。
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