导致小时候发烧高肌肉萎缩的原因可能有以下几种可能：
1. 神经疾病：一些神经疾病，如肌张力障碍、脊髓性肌萎缩症等，可能导致高热引起的肌肉萎缩。这些疾病会导致神经系统功能受损，进而影响肌肉的正常运动和生长。
2. 长期卧床：发热引起的肌肉痉挛和僵硬，加上长期卧床导致肌肉长时间没有得到正常的运动和锻炼，可能导致肌肉萎缩。这种情况主要发生在长期卧床不动的病情较重的病人，如重症患者或长期住院的病人。
3. 营养不良：发烧可能使食欲减退，造成摄入营养不足。长期缺乏足够的蛋白质、维生素和矿物质等营养物质，会导致肌肉无法得到良好的营养供给，从而引起肌肉萎缩。
4. 免疫系统紊乱：高热发作时，机体免疫系统可能出现紊乱，严重时可能导致免疫功能受损。这会导致机体对自身的组织产生异常的免疫反应，进而引起自身免疫性肌肉炎等疾病，导致肌肉萎缩。
5. 感染性疾病：一些感染性疾病，如急性病毒感染、细菌感染等，可能伴随高热发生。这些疾病对机体的新陈代谢和免疫功能都会产生影响，可能导致肌肉受损和萎缩。
总之，导致小时候发烧高肌肉萎缩的原因可能是多种多样的，需要根据具体情况进行诊断和治疗。
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