16岁男生身高问题不长个子受多种因素影响，其具体的原因和处理方法如下：
1、遗传因素：个人身高受父母的遗传基因影响较大。如果父母身高较矮，可能会导致子女身高不够理想。一般是无法改变基因，但可以通过其他途径弥补身高不足，比如通过跑步、打球等运动。
2、营养不良：不正确的饮食习惯、缺乏营养素对身高生长有一定的影响。需保证摄入足够的蛋白质、维生素、矿物质等营养物质，均衡饮食，尤其是多摄入富含钙的食物，如乳制品、海鲜、豆类等。
3、缺乏运动：缺乏适量的身体活动对身高生长不利。需坚持适度的运动，特别是拉伸性的运动，如篮球、跳绳、游泳等有助于拉长骨骼和促进身高的增长。
对于自身的身高情况要保持积极的心态，如果对自己身高有任何的疑惑，可以到医院就诊。
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