在5岁9个月的孩子矮小，可能是垂体上缘凹陷引起的，不是正常的情况。当垂体上缘凹陷时，可能会影响垂体的功能，导致生长激素的分泌不足，进而影响身高的增长。
在5岁9个月的孩子中，身高增长已经进入了该阶段的较后期，这时垂体上缘凹陷的影响就能够更明显地反映在身高上。通常情况下，5岁9个月的孩子男生的平均身高为110.2厘米，女生的平均身高为105.2厘米。如果孩子的身高明显低于这个平均值，那么就需要关注垂体上缘凹陷是否与之有关。
垂体上缘凹陷并不是唯一导致矮小的原因，其他因素也可能起到一定作用，比如家族遗传、营养不良、慢性疾病等。因此，要确诊是否由垂体上缘凹陷引起的矮小，需要进行一系列的医学检查，包括身高和体重的测量、骨龄测定、血清激素检查等。只有经过全面的评估，才能确定垂体上缘凹陷是否为矮小的唯一原因。
对于出现矮小的儿童，早期诊断和治疗是非常重要的。如果确诊为垂体上缘凹陷所致的矮小，可以考虑进行替代治疗，如生长激素替代治疗，以促进孩子的身高增长。此外，还需要与儿科专家和内分泌专家密切合作，制定个性化的治疗方案，包括营养改善、运动锻炼等，促进孩子身体的全面发展。
需要注意的是，每个孩子的身体发育速度不同，矮小并不一定意味着有病理性问题，但也不能忽视矮小可能存在的健康风险。因此，在发现孩子身高增长异常时，最好咨询儿科医生，进行相关检查，明确原因并及时采取相应的治疗措施。
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