HPV感染也可见于男性，HPV42和HPV53是HPV常见的亚型，虽然致病性较低，但少数情况下也可致病。
男性可以通过直接接触或间接接触感染HPV，其中性传播是最为常见的传播方式。接触HPV感染患者的生活用品，比如说牙刷、内衣内裤、毛巾等也可能会造成传播。
男性HPV42和HPV53感染最常见的疾病就是尖锐湿疣，通常出现在男性生殖器的头部或冠状沟周围，有时也可以出现在阴茎、会阴、肛门等部位。其次，尿道炎、包皮龟头炎等炎症性疾病也可见，会导致尿道刺痛、尿道排尿不适、阴茎红肿等症状。极少数情况下，还可诱发阴茎癌、肛门癌等。
治疗上，目前并没有特效药物可供选择，可以在医生指导下，使用胸腺肽、伐昔洛韦、干扰素凝胶等药物。如果出现有疣体，也可选择电灼治疗、激光治疗、冷冻治疗等。
正确使用安全套是减少性传播疾病感染的有效方法。男性接种HPV疫苗也可以帮助减少自身感染的风险。
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