孕妇在怀孕期间如果发现胎儿畸形，应在医生指导下进行相应的治疗。如果胎儿畸形比较严重，医生推荐引产，可以进行相关的引产手术。如果胎儿的畸形程度较轻，医生建议产后进行相应的治疗，可以进行产后手术或产后药物治疗，如唇腭裂修复和先天性心脏病的外科治疗等。如果孩子畸形对妊娠期间胎儿的健康和生存有害，则可在怀孕期间进行相关的宫内治疗，如治疗胎儿膈疝和尿路梗阻等。
胎儿畸形的因素
遗传因素，来自精子或卵子的基因突变或染色体畸变。受精卵中一种结构蛋白的基因突变会导致该蛋白的缺陷，导致该蛋白质器官结构不良所致的畸形。如果这种蛋白质参与了各种器官的组成，就会导致各种器官畸形。单基因突变引起的畸形与单基因遗传病所致畸形相同，遗传模式为孟德尔遗传模式。各种微效应基因也可以积累并与环境因素协同作用，从而导致畸形。这种多基因遗传所致的畸形多为单一畸形，如先天性心脏病、巨结肠、先天性髋关节脱位、肥厚性幽门狭窄等。
预防胎儿畸形的注意事项
1、做好怀孕前的准备工作，不要盲目怀孕，进行一些必要的测试，如风疹病毒检测。风疹病毒感染可导致先天性心脏病和先天性耳聋，风疹疫苗可用于预防风疹病毒感染。叶酸片可在怀孕前三个月服用，以防止胎儿神经管畸形。
2、在怀孕后立即建卡，定期检查，在14、20周进行唐氏筛查，28周前做B超检查等。这些检查可以检测胎儿在妊娠早期是否有异常。
3、预防生殖道传染病。生殖道传染病主要是由不洁的性行为引起的，因此规范行为，已被诊断为及时治疗。
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